Перечень структурных подразделений ООШ №94:
учебная часть;
библиотека;
пищеблок;
административно — хозяйственная часть;
дополнительное образование.

Органы управления:
общешкольное собрание — высший орган самоуправления, собирается по мере необходимости;
управляющий совет — орган самоуправления между собраниями;
педсовет — коллективно-профессиональный орган;
детская президентская республика <Радуга> — орган ученического самоуправления.

 Попечительский совет:
собрание трудового коллектива — коллективный общественный орган;
директор — руководитель образовательного учреждения;
заместитель директора по УВР — осуществляет управление учебно-воспитательным
процессом, обеспечивает его безопасность, организует методическую работу;
методические объединения — обеспечивают повышение профессиональных качеств педагогов, 
руководят системой повышения качества образования;
завхоз — организует ремонт помещений, хозяйственную работу, контролирует работу 
младшего обслуживающего персонала.
Основные формы координации деятельности аппарата управления в ООШ №94: совещание при директоре; совещание при завуче; оперативное совещание (планерка); педсоветы.